
scaffold 在基因中是什么? 希望能清楚点解释 - 知乎
scaffold 其实是基因组组装时的概念。涉及到的相关概念如下: reads:就是我们测序产生的短读序列,通常一代和三代的reads读长在几千到几万bp之间,二代的相对较短,平均是几十到几百bp。 contig:中文叫做重叠群,就是不同reads之间的overlap交叠区,拼接成的序列就是contig scaffold: 是比contig还要长的 ...
如何设计crisper-dcas9系统的gRNA,具体步骤是什么? - 知乎
tracrRNA(在CRISPR-Cas9编辑技术中被优化并命名为gRNA scaffold),它负责与Cas9结合,与重复序列具有同源性。 crRNA为引导序列,约20个碱基,具有特异性。
cas12a的crRNA该怎么去设计与寻找? - 知乎
比如我想去检测hpv,我现在该如果去设计我的crRNA?有偿!我真的不想再一个人鬼打墙了!
cas12a的crRNA该怎么去设计与寻找? - 知乎
最近Marraffini团队发表在MC上发表的一篇文献介绍了如何设计高效的Cas13a-crRNA(marraffini.rockefeller.edu)值得我们去学习应用,大家如果有在做Cas13a检测的可以点进去学习一下。 目前对于Cas12a的检测DNA应用较多,今天主要是和大家一起学习一下如何设计高效Cas12a-crRNA引物。下文是发表在nature期刊上的一篇 ...
CRISPR/Cas9系统中的crRNA和tracrRNA是什么? - 知乎
Sep 16, 2019 · crRNA是 CRISPR RNA 的简写,tracrRNA是 trans-activating crRNA 的简写。crRNA以前体pre-crRNA的形式被转录,tracrRNA单独转录,tracrRNA和pre-crRNA通过碱基配对作用结合,经过 RNaseIII 修剪,并与 Cas9 结合,成为具有DNA切割能力的复合体。 现在人工改造的版本中tracrRNA和crRNA被整合成了一个RNA转录出来,通过碱基配对 ...
编程中的脚手架是什么意思? - 知乎
The compiler uses this specification to generate code that the application can use to create, read, update and delete database entries, effectively treating the template as a "scaffold" on which to build a more powerful application. 翻译过来就是: “脚手架”是一种元编程的方法,用于构建基于数 …
请问做基因家族鉴定,blast比对之后如何进一步筛选?如何基于保 …
通过RT-qPCR验证,Ppseudocerasus_HiC_scaffold_3_1741(CpMYB10)在红色果实中的表达量显著高于黄色果实,而Ppseudocerasus_HiC_scaffold_1_3492(CpMYB4)则表现出相反的表达模式。 这些结果表明,CpMYB10和CpMYB4可能分别作为激活因子和抑制因子参与花青素生物合成的调控。 图例说明:
联邦学习该如何入门,学习路径怎样,有没有好的demo,以 …
二阶段,实现fedavg,并精进 没错,看完开山论文和几篇综述你就可以跑实验啦!你没有听错 所有联邦学习的老祖宗——FedAvg算法 当你看懂、并成功运行fedavg后,你对联邦学习的理解就会进入第二阶段 在此之前,如果你没学过pytorch,可以找个短一些的视频,10个小时就足够啦! 真的不建议,上来就 ...
什么是sgRNA? - 知乎
Oct 26, 2017 · sgRNA 是大名鼎鼎的基因编辑神器 Cas9 系统的“指挥中心”,可以引导 Cas9 对 DNA 进行定点编辑。经过无数大牛的积极探索,逐渐成熟的 Cas 9 基因编辑技术因其操作简单、编辑效率高等优势而席卷全球。因此,Cas9 基因编辑技术被称为诺贝尔奖级别的发明。不过Cas9 也有“看走眼的时候”,它将靶点 ...
常见的Cas12a酶类它们的crRNA的直接重复序列(又名DR区 …
关于Cas12a crRNA的直接重复序列(DR区或Scaffold区)的具体序列,这个信息可以因物种来源的Cas12a酶而异。 通常,DR序列是crRNA中高度保守的部分,它在生物体的CRISPR阵列中重复出现,分隔每个spacer序列。